Et væsentligt element for udformningen af strategien for avlsarbejdet i Gudenåens Ørredfond har været at ophjælpe allerede eksisterende havørred-stammer i Gudenå systemet. Det har derfor i årtier været målet at opfylde udsætningsplanernes mål for udsætning med direkte afkom fravildfisk opfisket så tæt på udsætningsstedet som muligt.
Vort slogan for avlsarbejdet er:Kvalitet over kvantitet.
Moderfiskene til avlsarbejdet opfiskes derfor spredt over væsentlige strækninger på de enkelte delvandløb således:
Efter endt strygning bliver alle fangede moderfisk genudsat så tæt på fangststedet som praktisk muligt.
Under udklækning og i den efterfølgende opvækstperiode på klækkeriet, holdes havørrederne fra de enkelte delvandløb separerede, og de efterfølgende udsætninger i de enkelte delvandløb foretages med "egne" fisk.